确因公共利益需要填堵河道、覆盖河道、调整河道水系的，应当按照规定的权限由水行政主管部门审查同意后，报同级人民政府批准。建设单位应当按照等效等量原则就近兴建替代补偿工程或者采取功能补救措施。
替代补偿工程或者功能补救措施，应当按照水行政主管部门审查同意的期限、标准实施，通过验收前，不得填堵、覆盖需占用的河道、调整河道水系。
涉及航道的，还应当经交通行政主管部门审查同意。
第二十三条 临河、穿河、跨河建（构）筑物和有关设施严重影响防洪排涝安全的，由水行政主管部门根据防洪标准和有关技术要求提出整治意见，报经同级人民政府批准后，责成建设单位或者管理运行单位在规定的期限内改建或者拆除。汛期影响防洪安全的，必须服从防汛指挥机构的紧急处理决定。
第二十四条 新建、改建、扩建入河排污口，应当符合河道规划和水（环境）功能区划要求，经有管辖权的水行政主管部门审查同意后，由环境保护行政主管部门审批环境影响评价文件。
截污管网覆盖的地区未经批准不得设置入河排污口，经批准设置的排污口应当达标排放。
第二十五条 河道水（环境）功能区已经划定的，不得擅自改变；在尚未划定水（环境）功能区的河道进行建设和开发利用活动，不得影响相邻已划定水（环境）功能区的水域功能。
河道水（环境）功能区水质未达标或者入河水污染物总量超过控制指标的，环境保护行政主管部门应当暂停审批影响水域使用功能的建设项目和开发利用活动的环境影响评价文件。
第四章 河道利用
第二十六条 确需在河道管理范围内新建、改建、扩建的各类工程建设项目，包括开发水利（水电）、防治水害、整治河道的各类工程，跨河、穿河、穿堤、临河的桥梁、码头、道路、渡口、管道、缆线、取水口、排水口等建筑物及设施，厂房、仓库、工业和民用建筑以及其他公共设施，其工程建设方案在按照国家规定的固定资产投资管理程序报批前，应当经有管辖权的水行政主管部门审查同意。
在审批或者建设过程中，建设项目的性质、规模、地点确需变更的，建设单位应当向原审查的水行政主管部门重新办理审查手续。
