（一）项目申报
按照《中央农村环保专项资金环境综合整治项目申报指南（试行）》（财建便函〔2009〕17号）的具体要求，坚持逐级上报、专家审核、层层筛选的原则。项目由县（市）、区政府组织申报，市财政、环保部门审查，经市政府同意，报省财政厅、环保厅初审，经省农村环境连片综合整治工作领导小组审核同意后报财政部、环保部备案，并下达各市组织实施。
（二）项目实施
乡镇政府为农村环境连片综合整治项目责任主体，负责组织具体项目建设。乡镇政府在省财政厅下达资金预算20个工作日内，将经市财政、环保部门审核同意的项目实施方案报省财政厅、环保厅审查，并根据审查意见进行修改，修改完善后报省环保厅备案。项目一经批准，申报单位不得擅自调整、改变建设内容，不得降低目标要求、压缩投资规模。如确需调整，须经市财政、环保部门审核同意，报经省财政厅、环保厅批准。项目采取公开招投标方式，由县（市、区）环保、财政局根据整治项目实际统一安排招投标，乡镇政府负责组织具体项目施工。县（市）、区环保部门在项目实施20个工作日内将项目设计施工图纸、招投标文件、工程预算书、工程施工合同等材料报市环保局，汇总后报省环保厅备案。市环保、财政部门要加强对项目的指导、督促和考核验收，并在县（市）、区政府提出项目工程竣工验收申请1个月内组织相关部门及行业专家开展验收，市环保部门在项目通过工程验收40个工作日内将工程竣工报告、项目决算书等报省环保厅备案。省直管县、财政直管县项目的申报、实施、管理办法由省财政厅、环保厅依照有关规定另行制定。
（三）实行农村环境连片综合整治项目公示制
各级环保、财政部门要及时在当地主要新闻媒体、本部门门户网站公布项目实施、资金使用及验收考核情况。乡镇政府要会同村委会将项目建设内容和资金安排在村庄张榜公布。
（四）时限要求
整治项目建设期为1年，各项目实施方案要明确项目的实施进度安排，列出工程量进度与时间对照表，作为项目实施进度后期考查依据。
2011年度农村环境连片综合整治项目应于2011年6月20日前完成项目实施方案的制定工作，7月底前完成招投标工作，8月20前开工建设，11月底前主体工程完工。2012、2013年度工作进度按省、市当年工作部署要求进行。
七、资金管理
（一）整治项目建设资金来源
中央财政将在三年内向我省投入专项资金9亿元，用于农村环境连片综合整治，其中2011年2.5亿元、2012年3亿元、2013年3.5亿元。中央和地方财政按1：1的投入比例。省、市、县三级资金配套比例为3：4：3，省直管县、财政直管县省、县两级资金配套比例为5：5。市、县配套资金由市、县财政局负责落实，鼓励县（市）、区增加配套资金。
